Ao abrigo do Protocolo celebrado entre a Direcção Regional da Cultura e a Capitania do Porto da Horta (Marinha Portuguesa), e no âmbito do projecto "Baleiaçor", o Museu do Pico procedeu, ao longo dos anos 2008, 2009 e 2010, à digitalização de todo o acervo documental baleeiro na posse das Delegações Marítimas das Lajes e de São Roque do Pico.
Esta importante iniciativa, absolutamente decisiva para o conhecimento e para o estudo científico da história da baleação açoriana, e da ilha do Pico, em particular, permitiu digitalizar, aproximadamente 20 000 documentos, que, uma vez inventariados, catalogados e sistematizados, serão disponibilizados à comunidade científica para futura investigação.
Nesta riquíssima e diversificada massa documental, podemos encontrar, entre outra, a seguinte documentação: bilhetes de identidade da Casa dos Pescadores da Horta, cédulas de inscrição marítima, correspondência diversa, escrituras de constituição de Sociedades Baleeiras, mapas de captura, estatísticas da pesca da baleia e da pesca local, mapas e boletins da actividade baleeira, regulamentação da pesca de cetáceos, requerimentos para licenças de construção de embarcações (botes baleeiros e lanchas baleeiras), certificados e registos de propriedade, licenças, processos de motorização, documentação sobre as Fábricas da Baleia de São Roque do Pico (Sociedade "Armações Baleeiras Reunidas, Lda.,") e das Lajes do Pico (Sociedade Industrial Baleeira Insular, Lda.,), documentação diversa, etc.